В 1948, когда Национальная партия пришла к власти, Фервурд баллотировался в нижнюю палату парламента, однако позднее в том же году был избран в сенат. В 1950 он был назначен на пост министра по делам банту в кабинете Даниеля Малана и добился принятия законов, позволивших правительству практически полностью контролировать отношения между расами (т.н. апартеид). Сохранил министерский пост в правительстве Йоханнеса Стрейдома, сменил его на посту премьер-министра в сентябре 1958. Автор закона о самоуправлении банту, согласно которому предусматривалось расселение черных африканцев в особых хоумлендах (черных штатах). В начале 1960, после того как волнения африканцев, протестовавших против обязательного ношения удостоверения личности, были жестоко подавлены, Фервурд получил два выстрела в голову с близкого расстояния от Дэвида Пратта, белого фермера, впоследствии признанного психически больным.
После выздоровления Фервурд возобновил усилия по выполнению своей программы апартеида, предусматривавшей разные законы для белых, цветных азиатов и африканцев (черных). В октябре 1960 получил поддержку большинства белого электората на референдуме, где решался вопрос, быть ли Южной Африке республикой или оставаться зависимой от британской короны. В марте 1961 правительство объявило, что из-за критики его расовой политики членами Содружества Южная Африка не останется в составе Содружестве после провозглашения республики 31 мая 1961. На выборах 1961 и 1966 Национальная партия завоевала прочное большинство в парламенте.
Фервурд был убит в Кейптауне 6 сентября 1966.