Репертуар Зилоти как пианиста и дирижера отличался необычайной широтой, включал множество современных произведений. Его фортепианной игре были присущи гармоническая ясность, классическая строгость и изящество звуковой палитры. Как дирижера пресса оценивала его более критически, отдавая, однако, дань грандиозному просветительскому размаху составляемых им программ. Зилоти был великолепным организатором: так, во время учения у Листа он создал Листовское общество; живя в 1880-е годы в Лейпциге, организовал концерты Чайковского в Гевандхаусе; Зилоти был единоличным менеджером своих концертных циклов. С 1915 он начал проводить общедоступные и бесплатные народные концерты. Антреприза «Концерты А.Зилоти» (как и возникшая позже другая частная антреприза «Концерты С.Кусевицкого») выступала противовесом весьма академизировавшейся к этому времени деятельности основной концертной организации страны Императорского русского музыкального общества (ИРМО). Зилоти считал, что его концерты должны знакомить слушателей с любыми новыми течениями в искусстве, независимо от их особенностей и от его собственных вкусов. Отдельной его заслугой является постоянная популяризация в России творчества Баха как его клавирных и камерных произведений, так и оркестровых циклов и кантат; страстный листианец, он часто включал в программы сочинения Листа, одним из первых познакомил Петербург с Брукнером и Р.Штраусом, много исполнял французских современных авторов (Дюка, Шоссон, Равель и др.). После 1911 он постоянно включал в программы произведения Скрябина, а затем и Стравинского, Метнера, Прокофьева, Мясковского; в его концертах принимали участие крупнейшие русские и зарубежные солисты и дирижеры.
После Февральской революции Зилоти был избран управляющим труппой Мариинского театра. В конце 1919 через Финляндию он эмигрировал в Германию, в 1922 в США. С 1926 преподавал фортепиано в Джульярдской школе при Колумбийском университете. До глубокой старости выступал как пианист, особенно часто с произведениями Листа.
Умер Зилоти в Нью-Йорке 8 декабря 1945.
Александр Ильич Зилоти. 18631945. Воспоминания и письма. Л., 1963